据生态环境部发布，截至2020年5月9日，全国医疗废物处置能力为6119.3吨/天，相比疫情前的4902.8吨/天，增加了1216.5吨/天。其中，湖北省能力从疫情前的180.0吨/天提高到658.4吨/天，武汉市能力从疫情前的50.0吨/天提高到280.1吨/天，黑龙江省牡丹江市能力从疫情前的8.0吨/天提高到31.0吨/天，内蒙古自治区满洲里市能力从疫情前的2.0吨/天提高到7.5吨/天。吉林省吉林市总能力可达100吨/天。自1月20日以来，全国累计处置医疗废物34.9万吨。
5月9日当日，全国共收集处置医疗废物3399.6吨，医疗废物处置负荷率55.6%。湖北省收集处置137.8吨医疗废物。武汉市收集处置54.9吨医疗废物。牡丹江市收集处置7.8吨医疗废物。满洲里市收集处置1.5吨医疗废物。吉林市收集处置7.3吨医疗废物。重点地区医疗废物处置负荷率均在50%以下。
对全国医疗机构污水处理设施和接受医疗污水的城镇污水处理厂进行排查，累计发现治污设施运行管理不规范、末端消毒落实不到位等问题471个，已全部整改完成。目前，全国医疗污水处理平稳有序，均严格落实消毒措施。
2020年1月20日至5月9日，337个地级以上城市空气自动监测结果表明，平均优良天数比例为87.7%，优良天数比例比去年同期上升4.9个百分点。全国pm2.5平均浓度为37微克/立方米，同比下降14.0%。1864个国家水质自动站预警监测数据显示，与去年同期相比，ⅰ～ⅲ类水质比例上升8.7个百分点，ⅳ、ⅴ类水质比例下降5.5个百分点，劣ⅴ类水质比例下降3.1个百分点。
累计对饮用水源地开展监测44376次，包括湖北省、武汉市、牡丹江市、满洲里市、吉林市在内，未发现受疫情防控影响饮用水源地水质情况。